תקלות נפוצות של
קופסאות הכפפות כוללות כלבי ים שחוקים או פגומים, נזילות גז, כשלים במערכת בקרת לחץ, כשלים חיישנים, רוויה יבשה וזיהום פנימי. בלאי כלבי ים עלול לגרום לדליפת גז, ולהשפיע על הסביבה האינרטית בתוך הקופסה. תקלות במערכת בקרת הלחץ עלולות להוביל ללחץ פנימי לא יציב, ולהשפיע על תנאי הניסוי. כשל חיישנים עלול לגרום לניטור לא מדויק של הסביבה בתוך התיבה, ובכך להשפיע על תוצאות הניסוי. בנוסף, אם יבוש לא מוחלף במשך זמן רב, הוא עלול לאבד את יכולת ספיגת הלחות שלו, וכתוצאה מכך עלייה בלחות בתוך הקופסה. זיהום פנימי עשוי להשפיע על טוהר חומרי הניסוי ועל דיוק הניסויים. תחזוקה ובדיקה שוטפת חיוניים למניעת תקלות אלה.